次日，“五省联军皖军总司令、安徽军务善后督办”陈调员，加入国民革命军的消息传遍了全国，安徽境内全省震动。
皖军内部将领王普，刘凤图等师旅长见他们的最高长官已经投诚，纷纷效仿，各自派人秘密联络北伐军自谋出路，蚌埠、合肥等地驻军军心浮动，逃兵数量激增数倍，基层军官公开议论“北洋政府气数将尽。”
12月17日，安徽境内皖系部队得知“主将”已经投诚的消息之后，主动后撤数十里，放弃了所有的据点，北伐第7军不费吹灰之力，便控制了安徽大部分区域。
12月18日，北伐中路军前锋推进至浙江衢州，与浙军第3师师长周凤起部接触，
早在，10月中旬，浙江省长夏超趁江西战事焦灼之时，便宣布浙江独立，自己就任国民革命军第18军军长，出兵进攻上海，虽然被孙传芳调来的孟昭月嫡系第二师镇压，
但是却动摇了浙军的军心，周凤起本就为浙军本土将领，早就不愿为孙传方卖命，就是在国民党代表郭灿等人的策动下，北伐军刚到衢州城下，其便宣布起义。
原浙军第三师改编为国民革命军第26军，周凤起任军长，郭灿任党代表。
18日下午，周凤起，起义的消息传到了孙传方的耳中，他当即勃然大怒，任命孟昭岳为浙江总司令，率领联军嫡系第2师、第10师总计约3万人，南下衢州平叛。
时间至1926年12月下旬，北伐军自江西出兵仅仅月余，便拿下了福建全省、安徽大部以及浙江西部，控制区域也从珠江流域推进至长江下游地区，部队边打边扩军，兵力越来越多，从最开始的10万人扩充至30万人。
孙传方的五个省仅仅只剩江苏全省、浙江北部与上海一隅，全军覆没已成定局。
12月23日，孟照月率领3万人与周凤起的起义部队，在富阳、桐庐一带激战，第26军出战受挫，被迫退回衢州固守。
就在26军固守衢州之时，东陆军第一军主力从福建北上，进入浙南温州一带，与中路军形成了南北夹击杭州的态势，孟昭月顿时腹背受敌，被迫退守至杭州外围防线。
12月27日，北伐军南北两路前锋均已抵达杭州外围，收复浙江全省的战略目标，即将实现，就在此时，北伐军内部却出现了一条争论。
武汉方面的唐升智，邓引达主张先行北上，与冯玉翔的国民师会师河南，直捣北平，完成大一统。
以总司令嫡系为首的将领，何应亲等人则主张应该先彻底消灭孙传方，占领经济富庶的江浙沪地区，获得江南财政支持与工业支撑之后，再直捣北平。
与此同时，北伐军内部不光是战略方案出现了问题，就连迁都的问题，也出现了不同的声音。
国党中央党部与国民政府决定迁都武汉，毕竟武汉三镇作为九省通衢之地，又位于整个中国中部，本就是吴配孚选择的大本营，自然有其中的道理。
但是此时武汉三镇处于第八军唐升智的占领之下，守城部队大都不是总司令的嫡系，总司令非常害怕，于是，他向中央党部提出意见，要求把广州国民政府迁都至其嫡系部队控制的南昌，便于总司令掌控中枢。
军事上有意见分歧，政治上也有矛盾，但是此时总司令麾下兵力已超过30万，话语权贼重，于是他决定在南昌总司令部内主持召开最高军事会议。
12月29日，李云龙本欲率领第18军继续向前逼近杭州，奈何总司令一封急电，急召他回南昌参加军事会议，他不得不命令部队停下脚步，就地休整，自己亲率亲卫队返回南昌。
12月31日夜，除了第八军军长唐升智，其余各军主将，以及国幼人员，全部返回了南昌。
1927年1月1日，南昌最高军事会议在总司令部内召开，参会人员包括第一军军长何应亲、第二军军长谭延凯，第三军军长朱培得，第六军军长程前，第七军军长李宗人，第十八军军长李云龙，以及司令部参谋长白崇喜，国幼代表张静姜等人。
南昌会议整整讨论了七日，最终达成了三项核心决议。
在军事战略方面，总司令否定了唐升智、邓引达等人“先行北上”的方案，确定“何应钦等人先定东南，再图中原”的战略总方针。
同时，把北伐军全军编为东、中、西三路，东路由何应亲任总指挥，白崇喜任前敌总指挥，下辖第1军、第17军、第19军和第26军，共计6万余人，从福建，浙江南部出兵，率先攻打杭州、上海，在会同中路军进攻南京。
中路军由总司令亲自节制，分为江左、江右两军，江右以程前为总指挥，率领第2，第6，第40军沿长江南岸推进。
江左则以李宗仁为总指挥，率领第7军，第10军，第18军沿长江北岸推进，最后与江右、东路军会合，攻取南京。
西路军则以唐升智为总指挥，下辖第8、第35、第36军等，共约10万人，坐镇两湖地区，警戒河南方向的奉军与直鲁联军，防止其南下。
在政治部署上，南昌会议决定，要求国民党中央党部与国民政府“暂住南昌。”，同时秘密命令部队，截留途经南昌的国党中央委员，将中央权力置于总司令的军权控制之下，希望凭此与武汉左派政权形成分庭抗礼之势。
在财政上，总司令提前设立好江浙财政委员会，自己亲任财政委员会会长，何应亲、李云龙等黄埔嫡系将领任副会长，希望接管东南财税之后，能够为后续作战提供持续的经费保障。
1927年1月7日,南昌会议正式结束,会议之后,各军主将立即前往自己部队的驻扎之地，按照部署向指定的地区集合，一场决定东南命运的总攻即将打响！
李云龙回到第18军驻军之地后，立刻着手安排相关事宜，1月10日，武汉方向在得知南昌会议的“暂都南昌”决议之后，立即联名通电斥责总司令。
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